PythonとPandas：表形式データの強力な操作術【BI入門⑤】

PythonのPandasライブラリで表形式データを効率的に操作する方法として、データ読み込み、表示、統計量取得など、データ解析の基礎を解説します。

私が読んだバイオインフォマティクス技術書レビュー【R、番外編】

R関連の技術書を実体験を交えて紹介します。初学者向けから中級者向けまで、Rの基本操作やtidyverse、データサイエンスの実践的な内容を網羅。学習スタイルやコマンド実行の工夫にも触れ、読者が自分に合った方法で継続できるよう丁寧にまとめています。

【効率化】知っていると便利な Linux コマンド集 10 選【バイオインフォマティクス】

バイオインフォマティクスで便利な Linux コマンド 10 選。ファイル破損確認、圧縮ファイル閲覧、バックグラウンド実行など、作業効率化のコツを紹介します。

Python入門：Windows上でのPython・Jupyter実行環境構築【BI入門④】

Windows上でのPythonとJupyter Notebookのセットアップや、BioPythonを導入してFASTA形式の塩基配列データを読み込む基本的な方法を解説します。

空間的遺伝子発現解析入門②

空間的遺伝子発現解析のうち、シーケンスベースの代表的なプラットフォーム (Visium, Visium HD, Stereo-seq) を解説します。

私が読んだバイオインフォマティクス技術書レビュー【Linux、Python編】

バイオインフォマティクスに役立つ技術書を実体験を交えて紹介します。LinuxやPythonの基礎から応用まで、初心者向けの書籍を中心にコメント付きで解説。言語選びや学習のコツも添え、気軽に学び続ける姿勢の大切さを伝えています。

空間的遺伝子発現解析入門①

空間的遺伝子発現解析は、組織内のどこで、どの遺伝子が機能しているかを明らかにする技術です。本記事では、その基本的な概念から、Visium や Xenium などを含めたプラットフォームの概要を説明します。

Rによる生物データハンドリング【BI入門③】

統計解析ソフトRでのデータハンドリング（データ取得、Rへの読み込み）から、Bioconductorのインストール方法まで解説します。

airwayデータでGSEA解析やってみた：ORAとの違いも解説【後編】

本記事では、前編で準備したairwayデータを用いて、**ORA（Over-Representation Analysis）とGSEA（Gene Set Enrichment Analysis）**の実行例と可視化方法を紹介しています。RのclusterProfilerパッケージ

R実践：データの可視化と関数活用【BI入門②】

統計解析ソフトRでのデータ操作と可視化を解説。関数電卓としての利用や、散布図・ヒストグラム作成の基礎を解説します。

airwayデータでGSEA解析やってみた：ORAとの違いも解説【前編】

本記事では、R環境でのGSEA（Gene Set Enrichment Analysis）解析の実践的な流れを、airwayパッケージの公開データを用いて丁寧に解説しています。ヒト気道平滑筋細胞に対するステロイド処理の有無による発現変動をDESeq2で解析し、その結果をもとにエン

JupyterLabを使ってみよう【Python】

Pythonの統合開発環境JupyterLabのご紹介！

知らないと損する！肥大化したWSL2のディスク容量を解放し、Docker環境をクリーンに保つベストプラクティス 🔖 1

WindowsのWSL2（Windows Subsystem for Linux 2）とDockerを使用する人が直面しがちな「Cドライブの容量が突然ゼロになる」問題について、その原因と具体的な解決策を解説

R入門：環境構築と基本操作【BI入門①】

バイオインフォマティクスを独学で学ぶ方に向け、統計解析ソフトRの各OSでの動作や実行環境の選び方、Rの基本をご紹介します。

今さら聞けない仮想環境【Docker】

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Windows PC上にLinux の仮想環境を作る WSL2（Windows Subsystem for Linux version 2）の導入方法をご紹介します！

【シングルセル解析】凡例の順番を変える【Seurat】

Seuratを用いたシングルセル解析の可視化における凡例の操作方法についてご紹介！

【シングルセル解析】クオリティコントロールの概要【QC】

シングルセル解析におけるクオリティコントロール (QC) の基本的な概念を解説！

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Rパッケージ venn.diagram を用いて2円のベン図を描画する際の注意点をご紹介します。

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